换一批
换一批核桃SPL基因家族的系统进化和表达分析
Phylogenetic Evolution and Expression Analysis of SPL Gene Family in Juglans regia
摘要：
[目的]SQUAMOSA promoter binding protein-like(SPL)转录因子在植物开花诱导中起重要的调控作用.从核桃基因组中鉴定SPL(JrSPL)基因家族成员并分析其表达特性,为探究SPL在核桃开花诱导中的功能研究提供参考.[方法]采用生物信息学方法鉴定JrSPL基因家族成员,并预测其基本理化性质、保守结构域、进化关系、启动子顺式作用元件等;利用转录组测序和RT-qPCR技术分析JrSPL家族成员在核桃不同组织及嫁接诱导开花后的表达水平.[结果]JrSPL家族有 28 个成员,其基因结构和蛋白结构均高度保守,分布在核桃 14 条不同的染色体,与拟南芥和毛果杨分别存在17 处和 24 处共线性关系,根据系统发育关系可分为 8 组.JrSPL启动子存在大量的光响应元件、激素应答元件、胁迫响应元件等.转录组测序分析显示,JrSPL基因在核桃不同组织表达量有差异,在雄花、雌花、顶芽及叶中均有表达,多数基因在雌花中的表达量都比较高,有 6 个基因最为显著,它们可能在开花诱导中起关键作用.在嫁接诱导核桃开花材料中,检测的 12 个JrSPLs中除了JrSPL8 外,在开花材料中的表达量均高于对照,JrSPL2 和JrSPL25 在混合花序的雄花中表达显著,JrSPL8 在顶芽中高表达.[结论]JrSPL基因在核桃成花中具有重要作用,其高表达是花期提前的主要因素.
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作者：
作者单位：
新疆师范大学生命科学学院 新疆特殊环境物种保护与调控生物学实验室,乌鲁木齐 830054
[1]
新疆阿克苏森林生态系统国家定位观测研究站,阿克苏 843100
[2]
期刊：
《生物技术通报》2024年40卷6期 180-189页
ISTICPKUCSCD
关键词：
核桃SPL基因全基因组鉴定组织特异性表达开花诱导Juglans regiaSPL genegenome-wide identificationtissue-specific expressionflowering induction
栏目名称：
研究报告
DOI：
10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2023-1171
发布时间：
2024-07-03
基金项目：
新疆维吾尔自治区三农骨干人才培养项目
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