换一批
换一批甘蓝型油菜REVEILLE家族鉴定及诱导表达分析
Identification and Induced-expression Analysis of REVEILLE Family in Brassica napus L.
摘要：
[目的]REVEILLE家族基因具有重要生物学功能,而在甘蓝型油菜(Brassica napus L.)中该家族基因研究较少,深入认识甘蓝型油菜中RVE家族基因功能及其与非生物胁迫的关系.[方法]利用生物信息学方法,在甘蓝型油菜、白菜(Brassica rapa)和甘蓝(B.oleracea)中分别鉴定到 33、16 和 16 个RVE基因,并对其系统进化、染色体定位、基因结构和理化性质以及启动子顺式元件进行分析.[结果]所有的RVE蛋白被分为两个亚家族.33 个BnaRVE分别定位在 18 条A亚基因组的染色体和 15条C亚基因组的染色体上.大部分成员属于较稳定的疏水蛋白;多数Ka/Ks值小于 1,说明该家族受到强烈的纯化选择作用.基因结构变异较大,内含子数目在 4-11 之间.共线性分析结果表明,甘蓝型油菜和拟南芥、白菜、甘蓝存在大量的同源基因.大部分甘蓝型油菜RVE家族成员在子叶和叶都有表达且表达量最多.BnaRVE启动子上含有大量与激素和生物逆境相关的元件,通过定量PCR分析,4 个BnaRVE在ABA与MeJA诱导和低温胁迫下的表达量显著上调.[结论]在甘蓝型油菜基因组中鉴定出 33 个BnaRVE家族成员.不同基因在不同发育时期和不同组织中表现出不同的表达模式.不同基因对各种胁迫存在响应,且表达模式不一.RVE家族成员对ABA、MeJA和冷胁迫具有正向响应功能.
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作者：
作者单位：
作物代谢调控与代谢工程实验室 湖南农业大学农学院,长沙 410128;作物表观遗传调控与发育湖南省重点实验室 湖南农业大学生物科技学院,长沙 410128
[1]
作物表观遗传调控与发育湖南省重点实验室 湖南农业大学生物科技学院,长沙 410128
[2]
期刊：
《生物技术通报》2024年40卷6期 161-171页
ISTICPKUCSCD
关键词：
甘蓝型油菜RVE基因家族生物信息学分析逆境植物激素表达分析表达谱Brassica napus L.RVE genes familybioinformatics analysisadverse stressphytohormoneexpression analysisexpression profile
栏目名称：
研究报告
DOI：
10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2023-1153
发布时间：
2024-07-03
基金项目：
国家自然科学基金
湖南省教育厅项目
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