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鳙BMP基因家族成员的鉴定、进化及表达分析

GENOME WIDE IDENTIFICATION,PHYLOGENY,AND EXPRESSION OF BONE MORPHOGENETIC PROTEIN GENES IN BIGHEAD CARP(HYPOPHTHALMICHTHYS NOBILIS)

摘要:

为了深入研究鳙(Hypophthalmichthys nobilis)骨形态发生蛋白(Bone morphogenetic protein,BMP)基因(Hyn-bmps)的结构、功能和表达特征,实验首先通过生物信息学方法对Hyn-bmps家族进行了全基因组水平的鉴定,利用qRT-PCR法检测其在不同组织和快/慢速生长差异个体中的表达模式.在鳙全基因组水平上共鉴定出不均匀地分布于13条染色体上的18个BMP家族成员.分子系统发育分析将BMP划分为5个亚家族;内含子-外显子结构和保守基序的分析结果不仅表明Hyn-bmps在进化上高度保守,也为鳙亚家族的分类提供了证据.18个bmps在鳙不同组织中具有不同的表达模式.群体中极端快/慢速生长差异个体的组织表达分析结果表明,绝大部分Hyn-bmps的高表达与快速生长呈高度正相关,提示它们在鳙机体生长和头部发育中具有正调控作用.研究结果不仅表明BMP基因家族在鳙生长与发育中扮演重要角色,而且也为鳙选择育种和分子育种研究提供了重要的基因资源.

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